Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fsip1Q9D3V5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fsip1Q9D3V5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fsip1Q9D3V5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms