Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pus10Q9D3U0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pus10Q9D3U0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pus10Q9D3U0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms