Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stag1Q9D3E6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stag1Q9D3E6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stag1Q9D3E6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms