Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrnp35Q9D384 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snrnp35Q9D384 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrnp35Q9D384 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrnp35Q9D384 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms