Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps33aQ9D2N9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps33aQ9D2N9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps33aQ9D2N9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms