Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Necap2Q9D1J1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Necap2Q9D1J1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Necap2Q9D1J1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms