Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtl8bQ9D1F0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtl8bQ9D1F0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms