Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ss18l2Q9D174 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ss18l2Q9D174 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l2Q9D174 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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