Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem53Q9D0Z3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms