Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rfc5Q9D0F6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc5Q9D0F6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms