Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mdm1Q9D067 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdm1Q9D067 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mdm1Q9D067 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms