Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf146Q9CZW6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf146Q9CZW6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf146Q9CZW6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf146Q9CZW6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf146Q9CZW6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf146Q9CZW6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf146Q9CZW6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms