Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcfc1r1Q9CYQ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms