Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis12Q9CY25 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms