Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo1Q9CXH7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo1Q9CXH7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo1Q9CXH7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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