Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed5Q9CXE7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmed5Q9CXE7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed5Q9CXE7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms