Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX63

Uncharacterized protein C17orf99 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CX63 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CX63 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CX63 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CX63 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CX63 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CX63 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CX63 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CX63 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CX63 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CX63 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CX63 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CX63 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CX63 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CX63 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CX63 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CX63 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CX63 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CX63 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CX63 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CX63 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CX63 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CX63 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CX63 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CX63 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CX63 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CX63 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CX63 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CX63 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CX63 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CX63 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CX63 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CX63 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CX63 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CX63 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CX63 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CX63 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CX63 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CX63 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CX63 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CX63 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CX63 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CX63 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CX63 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CX63 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CX63 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CX63 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CX63 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CX63 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CX63 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CX63 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CX63 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CX63 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CX63 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CX63 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CX63 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CX63 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CX63 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CX63 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CX63 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CX63 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CX63 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CX63 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CX63 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CX63 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CX63 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CX63 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CX63 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CX63 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CX63 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CX63 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CX63 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CX63 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CX63 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CX63 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CX63 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CX63 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CX63 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CX63 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CX63 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CX63 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CX63 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CX63 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CX63 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CX63 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CX63 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CX63 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CX63 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms