Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxxc1Q9CWW7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms