Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Psma8Q9CWH6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma8Q9CWH6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma8Q9CWH6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms