Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms