Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lhfpl3Q9CTN8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhfpl3Q9CTN8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms