Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pard3bQ9CSB4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pard3bQ9CSB4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms