Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ska2Q9CR46 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms