Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldnd1Q9CQX5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldnd1Q9CQX5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldnd1Q9CQX5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldnd1Q9CQX5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms