Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rwdd1Q9CQK7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rwdd1Q9CQK7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rwdd1Q9CQK7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rwdd1Q9CQK7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms