Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmed6Q9CQG0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed6Q9CQG0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms