Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Asf1aQ9CQE6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Asf1aQ9CQE6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asf1aQ9CQE6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms