Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chchd1Q9CQA6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chchd1Q9CQA6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms