Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Med4Q9CQA5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Med4Q9CQA5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Med4Q9CQA5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Med4Q9CQA5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Med4Q9CQA5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Med4Q9CQA5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Med4Q9CQA5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms