Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atg3Q9CPX6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atg3Q9CPX6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atg3Q9CPX6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg3Q9CPX6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms