Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl17Q9CPR4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpl17Q9CPR4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl17Q9CPR4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl17Q9CPR4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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