Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Npm3Q9CPP0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Npm3Q9CPP0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Npm3Q9CPP0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms