Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930550L24RikQ99PA7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930550L24RikQ99PA7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930550L24RikQ99PA7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930550L24RikQ99PA7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms