Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vgll1Q99NC0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll1Q99NC0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll1Q99NC0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129 ms