Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Acss1Q99NB1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Acss1Q99NB1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Acss1Q99NB1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Acss1Q99NB1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Acss1Q99NB1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Acss1Q99NB1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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Acss1Q99NB1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Acss1Q99NB1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Acss1Q99NB1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Acss1Q99NB1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Acss1Q99NB1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Acss1Q99NB1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Acss1Q99NB1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Acss1Q99NB1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Acss1Q99NB1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Acss1Q99NB1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Acss1Q99NB1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.8 ms