Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cds2Q99L43 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds2Q99L43 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cds2Q99L43 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms