Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn2aQ99KJ0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn2aQ99KJ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms