Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn3Q99JH7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clstn3Q99JH7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn3Q99JH7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms