Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg5Q99J83 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg5Q99J83 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg5Q99J83 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms