Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc30a1Q99J38 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc30a1Q99J38 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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