Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc8b1Q925Q3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc8b1Q925Q3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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