Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmo1Q924W9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo1Q924W9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo1Q924W9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms