Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msi2Q920Q6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msi2Q920Q6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msi2Q920Q6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msi2Q920Q6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Msi2Q920Q6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msi2Q920Q6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Msi2Q920Q6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi2Q920Q6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi2Q920Q6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms