Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Afg3l1Q920A7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Afg3l1Q920A7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms