Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx18Q91ZR2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx18Q91ZR2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms