Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Creb3l3Q91XE9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l3Q91XE9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms