Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps36Q91XD6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps36Q91XD6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps36Q91XD6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms