Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q91WD4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q91WD4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q91WD4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q91WD4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q91WD4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q91WD4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q91WD4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q91WD4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q91WD4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q91WD4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q91WD4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q91WD4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q91WD4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q91WD4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q91WD4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q91WD4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q91WD4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q91WD4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q91WD4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Q91WD4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q91WD4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q91WD4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q91WD4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q91WD4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q91WD4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q91WD4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q91WD4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q91WD4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q91WD4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q91WD4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q91WD4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q91WD4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q91WD4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q91WD4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q91WD4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q91WD4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q91WD4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q91WD4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Q91WD4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q91WD4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q91WD4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q91WD4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q91WD4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Q91WD4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q91WD4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q91WD4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q91WD4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q91WD4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q91WD4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Q91WD4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q91WD4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q91WD4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q91WD4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q91WD4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q91WD4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q91WD4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q91WD4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q91WD4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q91WD4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q91WD4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q91WD4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q91WD4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q91WD4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q91WD4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q91WD4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q91WD4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q91WD4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q91WD4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q91WD4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q91WD4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q91WD4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q91WD4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q91WD4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q91WD4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q91WD4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q91WD4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q91WD4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q91WD4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q91WD4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q91WD4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q91WD4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q91WD4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q91WD4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q91WD4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q91WD4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms