Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pth2Q91W27 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pth2Q91W27 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pth2Q91W27 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pth2Q91W27 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pth2Q91W27 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pth2Q91W27 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms