Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU6

Dcaf11, DDB1- and CUL4-associated factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf11Q91VU6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Dcaf11Q91VU6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Dcaf11Q91VU6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dcaf11Q91VU6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dcaf11Q91VU6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dcaf11Q91VU6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dcaf11Q91VU6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Dcaf11Q91VU6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dcaf11Q91VU6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms